进入三周目冒险，首先得完成二周目所有主线剧情。这时候大木博士会主动联系你，帮你把图鉴升级成386版。之后去枯叶市的港口坐船，选择前往第一座岛屿的火焰山。下船后往右边走，会碰到两个火箭队成员，击败他们就能进入山洞。洞里需要用怪力技能推动石头开路，最终在深处拿到红宝石。记得把红宝石带回给大木博士，他会奖励你一张七岛船票，这是开启三周目的关键道具。
下船后别急着探索，先去商店旁边的小屋和NPC对话，他会提示你去右边的冰洞。冰洞里地面很滑，需要借助石头改变移动方向。在洞深处击败火箭队成员后，会遇到四大天王之一的冰天王，帮忙解决敌人后他会告诉你一段密码。拿到密码后继续前进，在瀑布附近使用登瀑技能，就能找到隐藏的冲浪机器。
接下来坐船去5号岛屿，往左上角冲浪会遇见一位老伯，对话后得到波克比的蛋。继续往左前进，登上小岛进入山洞迷宫，这里可以收集五个隐藏道具。全部找齐后会被NPC带回家休息，之后就能解锁6号岛屿的剧情。在6号岛南边用居合斩砍树开门，触发蓝宝石争夺事件。虽然宝石会被火箭队抢走，但别担心，之后去5号岛的火箭队基地打败他们就能夺回蓝宝石。
最后带着蓝宝石回1号岛找博士，修复机器后就能解锁7-9号岛屿的传送功能。7号岛南边能捕捉安侬，8号岛洞穴深处有凤凰和洛奇亚，9号岛需要解谜红色三角形机关，完成后会出现30级迪奥西斯。这时候再回华蓝市左边的洞穴，就能遇见超梦并开启最终挑战。
记住三周目主要围绕七岛探索展开，每个岛屿都有独特剧情和神兽。多和NPC对话获取线索，合理搭配队伍技能比如冲浪、怪力、登瀑，能让你更顺利推进流程。如果中途卡关，不妨回之前岛屿再检查是否有遗漏的机关或道具。