舰船变形是无尽的拉格朗日中提升战斗灵活性的核心机制，但需要满足特定条件才能开启。玩家需达到35级后进入主界面的船坞系统，在拥有的舰船列表中选择目标船只并点击变形选项。该系统允许通过分解舰船部件并重组来改变外观与能力，每次变形会显著影响舰船的移动速度、攻击力、防御力、射程及特殊技能等属性，因此变形前需充分了解舰船原始属性和战术定位。
变形过程分为解体、核心消耗和形态确认三个阶段。解体需消耗资源并产出核心，核心是变形的必备资源，可通过战斗、任务或抽奖获取。每艘舰船的解体与变形均需一定时间，且不同稀有度的舰船提供的核心数量差异显著。拆解高稀有度舰船时需谨慎权衡，因其提供的模组和设计图对后期舰船研发至关重要，而普通出售仅能获得基础资源。
形态选择直接关联战斗模式，每艘舰船通常提供3-5种预设形态，分别对应不同战术定位。例如专注防御的形态适合前线抗伤，高速机动形态擅长突袭或规避，而中远程支援形态则配备诱导、干扰类技能。选择时需结合舰队整体配置和当前战场需求，单一舰船的形态变化可能改变整个编队的战术体系。部分特殊舰船如阋神星级还具备定制化武器系统，其变形后的火力增幅尤为显著。
变形完成后需消耗核心进行最终确认，系统会显示新旧属性的详细对比。建议优先对主力舰船实施变形，尤其是巡洋舰、战列巡洋舰等中大型舰种，其多形态差异带来的战术价值更高。需注意变形后的舰船若需恢复原形态，同样需要消耗核心与时间。实战中建议保留至少两种形态的配置方案，以应对不同强度的敌对势力或突发战况。
该系统通过部件重组机制实现了战斗策略的深度扩展，但过度频繁的变形会导致核心资源紧缺。合理规划变形节奏，结合舰队发展阶段选择性价比最高的变形方案，是长期运营的关键。对于新获得的舰船，建议先通过常规战斗熟悉基础性能后再考虑变形，避免因属性误判造成资源浪费。